Orientador: Angelina S. Palma e Ana Luísa Carvalho (Ciência ID: 6719-0FF9-816A e 351C-DCB9-6912)
DESCRIÇÃO:
O projeto vem complementar o estudo em curso da interação de proteínas da superfície celular da bactéria comensal Bacteroides thetaiotaomicron com glicanos típicos do epitélio gastro-intestinal. Para metabolizar estes glicanos, esta bactéria expressa uma grande variedade de proteínas codificadas em grupos de genes discretos, denominados PUL (Polysaccharide Utilization Loci). Os PUL codificam enzimas modulares ativas para hidratos de carbono (CAZYmes) associadas a módulos CBM (Carbohydrate-Binding Modules) e a proteínas do tipo Sus (Starch-Utilization System). O trabalho experimental terá como alvo 2 proteínas: um CBM da família 32 (Bt4040) e um SusD (Bt0866), já produzidas e parcialmente caracterizadas, mas para as quais é necessária a determinação e caracterização da especificidade para glicanos.
O trabalho implica a realização de experiências usando Microarrays funcionais de glicanos, Termoforese em Microescala e Cristalografia de Raios-X.